Explicó que el sistema anterior estaba “separando las autoridades de los pueblos“, por lo que decidió implementar un nuevo modelo. Otro motivo para este cambio fue la necesidad de “aumentar la defensa y seguridad de los poblados y de la madre tierra en caso de agresiones, ataques, epidemias, invasión de empresas depredadoras de la naturaleza, ocupaciones militares parciales o totales, catástrofes naturales y guerras nucleares.“

 En la Décima Parte: Acerca de las Pirámides y sus usos y costumbres. Conclusiones del análisis crítico de MAREZ y JBG, el capitán Marcos explica que “en resumen, se vio que la estructura de cómo se estaba gobernando, de pirámide, no es el camino.  No es de abajo, es de arriba. (…) Entonces lo que hicimos pues es cortar la pirámide.  La mochamos pues de la punta.  O más bien como que la volteamos, la pusimos de cabeza.“

Un primer nivel incluye los Gobiernos Autónomos Locales (GAL), que funcionan en cada comunidad o población con presencia de bases de apoyo zapatista. En general los GAL asuman la tarea, entre otros, de controlar sus recursos autónomos organizativos (como escuelas y clínicas) y de mantener la relación con pueblos no zapatistas vecinos. La coordinación de los GAL está integrada por agentes y comisariados autónomos.

Además de los GAL, se suman los Colectivos de Gobiernos Autónomos Zapatistas (CGAZ), que toman acuerdos sobre asuntos de interés para los GAL convocantes, organizando asambleas en donde participan las autoridades de cada comunidad. En dichas asambleas se pueden discutir y acordar planes sobre temas como salud, educación, agroecología, justicia y comercio. A nivel de CGAZ están los coordinadores de cada área. Lo importante es que los CGAZ no son autoridades, sino que realizan los trabajos definidos por los GAL. “Cada región o CGAZ tiene sus directivos, que son los que convocan a asambleas si hay algún problema urgente o que afecta a varias comunidades,“ explica el comunicado.