1 de enero: El décimo aniversario del levantamiento armado del Ejército Zapatista de Liberación Nacional no está acompañado por ningún comunicado político por parte de la Comandancia zapatista. Se celebra de manera interna en los Caracoles donde acude la sociedad civil nacional e internacional.

8 de enero: Se inicia una serie de manifestaciones de pobladores de la comunidad Emiliano Zapata (municipio de Tila, Zona Norte de Chiapas) exigiendo el retiro del Ejército. Bases de apoyo zapatistas y miembros del Partido Revolucionario Democrático (PRD) no sólo son respaldados por la sociedad civil sino también por miembros del Partido Revolucionario Institucional (PRI) que antes habían pedido la instalación de la base militar en el poblado y que ahora empiezan a pedir su salida frente a los efectos negativos de la presencia del ejército como el uso y el trafico de alcohol y drogas, o como la prostitución.

12 de enero: Tras denunciar el fraude electoral de las últimas elecciones, el municipio de Tlanepantla en el estado de Morelos se declara «autónomo«, nombrando su propio concejo autónomo. Días más tarde son reprimidos brutalmente por el gobierno estatal con saldo de un manifestante muerto.

21 de enero: Son liberados siete presuntos paramilitares del grupo Paz y Justicia. Se les absolvió de delitos del fuero común de los que estaban acusados, como homicidio y privación ilegal de la libertad, entre otros. Estuvieron presos en el penal de Cerro Hueco, desde el 13 de septiembre de 2002 cuando se realizó un operativo en la comunidad Miguel Alemán, donde las fuerzas de seguridad pública detuvieron a 27 otros miembros del grupo Paz y Justicia.

22 de enero: Son quemadas las casas de la comunidad Nuevo San Rafael en la Reserva de Montes Azules. Para la Secretaría de la Reforma Agraria (SRA) los habitantes habían decidido abandonar voluntariamente sus viviendas y retornar a su lugar de origen. ONG’s acusan a la SRA de haber dividido a la población hasta conseguir su salida de la reserva.

25 de enero: Samuel Ruiz, obispo emérito de la Diócesis de San Cristóbal de las Casas y ex presidente de la CONAI (comisión mediadora entre el Gobierno mexicano y el EZLN), presenta por primera vez desde que ha dejado su cargo la carta pastoral «Una nueva hora de gracia». De este modo, celebra el 44 aniversario de su ordenación episcopal, cuestionando entre otras cosas, el actual proceso de globalización y reconociendo el papel importante de los zapatistas en la emancipación de los pueblos indígenas en todo el continente latinoamericano.

27 de enero: El Gobierno del Estado de Chiapas firma un Convenio con la Unión Europea para cofinanciar el ‘Proyecto de Desarrollo Social Integrado y Sostenible de la Selva Lacandona’ (PRODESIS) que será ejecutado en la zona de amortiguamiento de la Reserva de Montes Azules. La contraparte europea destinará a dicho proyecto 15 millones de euros y otros 16 provendrán del gobierno del estado de Chiapas.

12 de febrero: El Centro de Análisis Políticos, Sociales y Económicos (CAPISE) publica su Informe: ‘La ocupación militar en Chiapas: el dilema del prisionero’. Como resultado de la investigación se ubicaron 91 instalaciones militares en la denominada ‘zona de conflicto’ de Chiapas.

17 de febrero: El Congreso del Estado de Chiapas aprueba la denominada «Ley Mordaza», por la que se realizarán modificaciones al Código Penal en delitos contra el honor. Se incrementan las sanciones hasta nueve años de cárcel y multas de hasta mil días de salario mínimo. Varias ONG’s denuncian que esto perjudica gravemente la libre expresión en Chiapas y pone en riesgo el oficio periodístico e incluso las víctimas de hechos delictivos ya que estos podrían ser demandados por difamación.

19, 20 y 21 de marzo: Tercer Encuentro Chiapaneco contra el neoliberalismo en Huitiupán (municipio de los Altos de Chiapas). Finaliza con una manifestación de l@s participantes para protestar contra la construcción de una represa en dicho municipio.

10 de abril: Bases de apoyo zapatistas del municipio de Zinacantán son emboscadas por miembros del PRD, dejando un saldo de decenas de heridos y 125 familias zapatistas desplazadas. El hecho se produjo cuando zapatistas terminaban una marcha celebrando el aniversario de la muerte de Emiliano Zapata, y tras repartir agua a habitantes de la comunidad de Jechvó, privados de ella desde hacía meses por miembros del PRD.

14 de abril: De visita en Chiapas, el secretario de Gobernación, Santiago Creel afirma que «Chiapas ha dejado de ser un dolor de cabeza para el gobierno federal» y que a pesar del enfrentamiento en Zinacantán «goza de estabilidad política». Califica dicho enfrentamiento de «incidente«.

15 y 16 de mayo: En la Reunión XIII de la Región Centro-Pacífico del Congreso Nacional Indígena (CNI) en Unión Hidalgo (Oaxaca), se ratifican los Acuerdos de San Andrés como «Constitución Indígena» y se propone seguir avanzando en la construcción de la autonomía por la vía de los hechos.

28 de mayo: Paralelamente a la III Cumbre de Jefes de Estado y de Gobierno de América Latina y la Unión Europea en Guadalajara, Jalisco, la sociedad civil celebra el foro «Enlazando Alternativas«, cuestionando la política de la Unión Europea en América Latina. La manifestación ‘anticumbre‘ acaba con 45 personas detenidas de forma arbitraria, golpeadas y torturadas. Ocho extranjeros son detenidos y expulsados arbitrariamente.

4 de julio: Familias de la comunidad San Francisco El Caracol de la Reserva de Montes Azules son trasladadas por el Gobierno al «nuevo centro de población» llamado Santa Marta en el municipio de Marqués de Comillas.

4, 5 y 6 de agosto: Inauguración del Centro de Promotores Educativos «Compañero Manuel» en el Municipio Autónomo Rebelde Zapatista «Ricardo Flores Magón».

7 y 8 de agosto: En el marco del Primer Aniversario de las Juntas de Buen Gobierno y los Caracoles Zapatistas, el EZLN emite una serie de comunicados llamados «Leer un video» en los que se realiza un balance de este primer año de funcionamiento, reconociendo los errores y defendiéndose de las críticas. Adicionalmente cada una de las Juntas presenta su informe alrededor de la gestión de los recursos económicos provenientes de la sociedad civil nacional e internacional.

16 de agosto: La Comisión Nacional de Derechos Humanos (CNDH) presenta un informe sobre las detenciones contra altermundistas en la Cumbre de Guadalajara de mayo. Confirma 78 detenciones ilegales, 70 casos documentados de tratos crueles y degradantes, 70 de incomunicación y seis casos de tortura.

17 de agosto: El Congreso Estatal de Chiapas aprueba la destitución temporal del Presidente de la Comisión Estatal de Derechos Humanos (CEDH), Pedro Raúl López Hernández. Varias ONG’s expresan su preocupación de que el objetivo sea limitar a la CEDH en la realización de su trabajo de denuncia de violaciones de derechos humanos.

1 de septiembre: El Presidente Vicente Fox Quezada presenta su cuarto informe del Gobierno frente a múltiples protestas dentro del Congreso, así como fuera del mismo. Por otro lado, la Junta de Buen Gobierno de La Realidad se pronuncia por primera vez en contra de los desalojos de comunidades en Montes Azules.

1,2 y 3 de octubre: Primer Encuentro Nacional de Afectados por las Represas en México, celebrado en Aguas Calientes, Acapulco, Estado de Guerrero, donde existe un movimiento de resistencia en contra de la construcción de la represa ‘La Parota’.

3 de octubre: Elecciones municipales en Chiapas, proceso que los zapatistas no obstaculizaron.

15 de octubre: El EZLN anuncia la reconcentración de comunidades zapatistas asentadas en la reserva de Montes Azules, solicitando ayuda económica por parte de la sociedad civil nacional e internacional.

16 de noviembre: José Luís Soberanes inicia su segundo periodo como Presidente de la CNDH, ante las protestas de los organismos nacionales de Derechos Humanos por la falta de consulta previa a su ratificación.

17 de noviembre: El EZLN cumple 21 años de haber sido fundado «en algún lugar de la Selva Lacandona». Los múltiples comentarios subrayan el largo camino que han recorrido los zapatistas en estos años: desde la guerrilla foquista y la insurrección armada al desarrollo de gobiernos autónomos. «En 1983 éramos seis; hoy somos miles» declara la Junta de Buen Gobierno de La Garrucha, durante la conmemoración interna que también se lleva a cabo igual en otros Caracoles.

27 y 28 de noviembre: Primer Diálogo Nacional por un Proyecto de Nación con Libertad, Justicia y Democracia en la Ciudad de México, convocado principalmente por organizaciones sindicales del país.

22 de diciembre: Séptimo aniversario de la masacre en Acteal. Varias ONGs de derechos humanos denuncian que a la fecha no se ha llevado a cabo una investigación imparcial y objetiva y que no se ha logrado hacer justicia.